Het Open Magazijn is de ruimte op de 1e kelderverdieping (de ‘-1’), te bereiken via de trap in het Informatiecentrum Huygens, voorheen overwegend bestemd voor gebonden tijdschriften. De meeste boeken en tijdschriften zijn uitleenbaar via de uitleenbalie (begane grond). De boeken met een rode stip op de rug zijn niet uitleenbaar, maar uitsluitend ter plaatse raadpleegbaar. De boeken en tijdschriften staan in dezelfde volgorde als eerder in het Instituut Kern in de Nonnensteeg. Aan de bewegwijzering wordt nog gewerkt.

Een klein deel van de collectie is nog niet beschikbaar. Het betreft hier materiaal dat in de Nonnensteeg in het gesloten magazijn (de kluis) stond, waaronder bijzondere (oblong-, folio- en plano-) formaten. Ook dvd's, en de 'Bon Kanon- collectie' (kwetsbaar materiaal), die in de UB niet open opgesteld kunnen worden, zijn nu nog niet beschikbaar. Er wordt hard gewerkt om ervoor te zorgen dat deze onderdelen van de collectie Kern zo snel mogelijk via de catalogus aangevraagd kunnen worden.